江戶時代，德川幕府當政。有一群人活動于黑暗中，他們叫做ヒルコ忍群。他們從黑暗中出生，在黑暗中死亡。　但是，傳說若能將從古代傳承下來的龍寶玉和光之巫女的力量結合，那么ヒルコ的人們也能沐浴到光芒。有一個人相信這一傳說，逃離了ヒルコ。　 故事就是從這里開始的。　同時，一伙被稱為鬼門眾的忍者開始盯上了被盜走的寶玉和隱居的光之巫女。這伙人是在替企圖再興豐臣家的暗公方活動。他們的目的是什么呢？在深深的謎團中，ヒルコ與鬼門眾為了寶玉展開了激烈的爭斗。