雖然先前日子在其他次元,有邪惡組織對爆丸世界的創始生命的覬覦奪取,但在爆丸戰士的守衛之下,并未對爆丸世界造成影響,再次讓爆丸世界回歸應有和平。時間來到一年后,爆丸Inter-space的發展急速澎漲,爆丸對戰亦出現了完善的聯賽賽制。而在比賽中,獨角巨龍屢次力量失控、當中衍生出來的暗黑爆丸的出現和大肆破壞,令小彈心理壓力不斷上升,其后更退出賽場,使爆丸戰士間的友情受到重大考驗。在此同時,有一支被稱作"渾沌軍團(Chaos Army)"的神秘參賽隊伍,對爆丸戰士與其他參賽者發動迅雷不及掩耳的震撼打擊,促使爆丸戰士與其他參賽者團結一致,立..