舞臺是公安9課還不是最重要的先遣沖鋒部隊A.D.2027。 在十分懂得權(quán)術(shù)、老謀深算的公安捜査的荒卷面前出現(xiàn)是——隸屬于陸軍501機關(guān)的草薙素子三佐。擁有最高度的物理與電腦作戰(zhàn)技能的她，和荒卷比起來顯得不諳世事。不過這樣的她也和荒卷共同行動，解決了很多犯罪事件。但這同樣引起了501機關(guān)的注意，尤其是作為上司以及保護者的女野心家久留津中佐產(chǎn)生了摩擦。 與此同時，謎樣的病毒“Fire Starter”出現(xiàn)了，在各種疑難事件群起之中，“擁有不眠之眼的前特部隊隊員”、“已經(jīng)成家的特捜刑事”等各種個性的人才匯聚到了草薙素子身邊。和荒卷有著共同..