動(dòng)畫(huà)片向日葵第二季全集又名忍者少女第二季故事以以學(xué)校被入侵，學(xué)生們的戰(zhàn)斗和逃亡和破解陰謀的危機(jī)生活為主。這里是充滿(mǎn)了日本風(fēng)情的偏僻鄉(xiāng)村——霞高原町，俗稱(chēng)“霞之里”。在村里有兩所極其特殊的忍者院。某日，一女一男造訪(fǎng)了這個(gè)村子。其中一個(gè)是為了與自己所憧憬的忍者“市川電藏”見(jiàn)面并拜之為師而入讀“私立志能備學(xué)園”的女孩子。而另外一個(gè)男性則是以?xún)?nèi)不小心在旅行路途被騙走了借金而不得不在村里的學(xué)校作為新上任的老師一邊上課一邊嘗還金錢(qián)的萬(wàn)里小路隼人。這兩人在“霞之里”的邂逅是偶然還是必然？他們認(rèn)識(shí)了霞之里中各色各樣的人們，并且一起經(jīng)歷著學(xué)院生活和災(zāi)..