世界受“魔甲蟲”威脅，大地遭其占據(jù)，人類如今只能住在天空中的浮游都市里。人類當(dāng)中誕生出以魔力對(duì)抗“魔甲蟲”的魔法師——空戰(zhàn)魔導(dǎo)士。就讀空戰(zhàn)魔導(dǎo)士培育機(jī)構(gòu)——學(xué)園浮游都市“密斯特崗”的彼方·英司，是被冠上“黑之劍圣”稱號(hào)的S128特務(wù)小隊(duì)菁英王牌。然而，如今他卻被視為“特務(wù)小隊(duì)的叛徒”而受到眾人輕蔑、厭惡。某天，彼方被任命為連戰(zhàn)皆敗的E601小隊(duì)教官。這支小隊(duì)收容了三名個(gè)性特異的少女——？由叛徒與問(wèn)題學(xué)生少女們展開的雄豪進(jìn)擊，現(xiàn)在啟動(dòng)！