在遙遠的Zi星球，生命是由金屬構成的，經過上億年的進化，出現了各種生物，也進化出了智慧生命：Zi星人。Zi星人對這些機械生命體進行改造，用于各種用途，當然，不可避免的，一部分被ZOIDS機械模型改造成為戰斗用的機械獸。這些機械獸被稱為ZOIDS。 　一次飛行事故，使得一艘地球飛船迫降到Zi星球。地球人有著比Zi星人發達的文明，他們的到來使得對于ZOIDS的改造有了徹底的改變。在Zi星1980年，對立的兩個國家海立克共和國和賽奈巴斯帝國展開了激戰，雙方都加快了戰斗性ZOIDS的開發。ZOIDS的近代史由此展開。